文莱海世通军曹鱼体形圆扁，躯干粗大，头平扁而宽；口大，前位，微倾斜，近水平而宽阔；吻中等大，约为头长的1/3；眼小，不具脂膜，为头长的1/7~1/10，眼间隔宽平，位于头两侧；前

额骨不能伸缩，上颌后端近眼前缘，下颌略长于上颌；鼻孔长圆形，每侧2个，与眼上缘处于同一水平；上下颌骨、腭骨及舌面具绒毛状牙带。背鳍硬棘短且分离，臀鳍具2~3枚弱棘。幼时尾鳍圆形，成体尾鳍则内凹呈半月状。尾柄近圆筒形、侧扁、无隆脊，第一背鳍8~10鳍棘、粗短，可收褶入沟中，胸鳍尖、镰状，腹鳍胸位，具1棘5鳍条。在养殖过程中，尾鳍形状有所变化，在130厘米时尾鳍为尖尾形，180厘米时尾鳍略成截形，300厘米以上时尾鳍渐变为深叉形。上叶略长于下叶。 鱼体表、颊部、鳃益上缘、头顶部、鳍基部均被小圆鳞，侧线前端为波状，胸鳍上方波位较大，后段平直达到尾鳍基部。

军曹鱼背部呈茶褐色，侧部浅褐色，

腹部白色；同眼宽的黑侧带从嘴延伸到尾鳍基，侧带上下有浅带；浅带下是更窄的暗色带。幼鱼黑侧带明显，但成鱼不明显。体延长，半圆柱形；头宽扁。嘴大，端位，下颌突出；颌、上腭和舌上具绒毛状齿。第一背鳍具7-9根(通常8根)单独的短、硬棘，嵌入凹槽，无膜相连；具28-33根软条。第二背鳍长，成鱼前部背鳍条稍高。胸鳍尖，年龄大的鱼变为钩状。臀鳍短于背鳍；具1-3根棘，23-27根软条。成鱼尾鳍新月状，上圆长于下圆突出(幼鱼尾鳍圆，中部鳍条延长)。鳞小，嵌入厚皮；侧线前部稍呈波浪状。